新冠来自美国吗?科大少年班学者解读

这两天被台湾东森电视的一视频刷屏,嘉宾潘砖家解读新冠来自美国。哈佛大学公共卫生学院博士、科大少年班校友林明详细指出这种乱带节奏的观点不可信。

这两天被图一(上图)和台湾东森电视的一个视频刷屏,视频是一个叫”这!不是新闻”的晚间谈话类节目,话题是热门的新冠病毒的来源。嘉宾潘砖家根据Wen Bin Yu等几个研究人员投稿的一篇文章,得出结论新冠来自美国。原始文章预发布在ChinaXiv平台(注1)上,有兴趣的可以去读一下。本来对这种娱乐为主的节目准备一笑了之,无奈拿这篇文章带节奏的营销号太多,而身边的朋友们可能觉得技术含量太低不值得一驳,身为理工男的我只好去读了原文,给大家总结以下几点吧:

1)刷屏的结论是病毒来源是美国,那么原文作者的结论是什么呢?看完原文你就会明白,他们的结论是武汉华南海鲜市场不是起源,只是快速传播的一个地点。真实情况更可能是真正的源头传到海鲜市场和武汉其他地方,然后继续传到全国各省和全世界。其实大家早就怀疑了海鲜市场不是源头,因为早期有好几个感染者并没有接触海鲜市场的经历,这篇文章只是从病毒序列的角度给这个怀疑增加了新的证据。

2)那么营销号们和这个台湾潘姓砖家的源头来自美国的结论又是如何得出的呢?那就是根据从原文中截取的著名的图一了,江湖号称五毒图。简单说一下逻辑是这样的:首先根据分析的样本序列发现病毒有58个分支,归纳为五大家族ABCDE,其中属于家族A的H13和家族B的H38被认为是祖先级别的两个序列,台湾砖家视频里称为爷爷级的,然后往后发展就有了其他被称为儿子级的序列,例如H3,和被称为孙子级的序列,例如H1。砖家于是说,看图一!中国几万例感染者,但全是H1类,那是孙子级的!但是看看美国,虽然才几十例,但是从爷爷到孙子各种类型都有!实锤!逻辑貌似非常完美。可惜细节都在原文里,而且专家眼神也不太好,没看见广东那块饼也是色彩斑斓。

3a)中国几万例真的全是孙子级的H1类吗?首先原文作者拿到的数据一共才几十例,其中来自中国的只有区区54例,湖北22,广东18,浙江4...

3b)湖北很多样本来自海鲜市场,确实全是孙子级的H1和H1演变出去的,支持作者的海鲜市场不是源头的结论。而且海鲜市场感染的人很多,所以孙子级的H1和它的子子孙孙貌似成了中国最多的类型。但是不代表中国只有孙子级的H1。

3c)那么中国有没有爷爷级的H13或H38呢?看看广东的18例,其中五人来自深圳是H13。看到这里请别急着认为源头可能跟上次的非典一样来自广东。作者文章里也说了,这五个人都去过武汉,应该是在武汉感染带回广东的。作者认为H13还是源于武汉,只是在他现有的武汉样本里没发现,毕竟整个湖北省他也就只有22个样本。

3d)关于美国的那例带有爷爷级类型的病例,文章里也有介绍,他携带的是H38,是美国确诊的第一例,之前去武汉探亲而感染,类似深圳那五个。

 

最后我想说,现在网络上充满着各种不同的观点,各自都容易去选择性地相信支持自己观点的信息,但是如果能多花点时间寻求真相,那么离理性的讨论就不会太远。独立思考,远离节奏党,分享图二(下图)以共勉。

关于作者:作者1993年考入中国科学技术大学少年班,1997年、2000年分别于获中国科大计算机软件学士、统计学硕士学位。林明2000-2004年就读于哈佛大学公共卫生学院并获生物统计学博士学位,拥有约15年制药公司经历,曾供职于美国Genetech(基因泰克)、Gilead Sciences(吉利德),曾任吉利德科学公司总监。曾在中国上海某创新药业公司担任生物统计学负责人、执行总监。本文仅代表作者的个人观点,与其现供职单位无关

本文尚在编辑中,链接对外尚未公布。请勿转载

注1:该论文《Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data》发布于ChinaXiv,论文地址为http://www.chinaxiv.org/abs/202002.00033。作者提及的图一引用自该论文

2020-03-02 上一篇: 陈鸥荣膺2020斯隆研究奖 下一篇: 悼朱国城教授|旧作:科大数学系三龙飞舞时